物流企業(yè)與快遞企業(yè)有著(zhù)本質(zhì)區別。按接收貨物重量，一般30公斤以上發(fā)物流；按服務(wù)對象，快遞一般為個(gè)人，物流一般為企業(yè)；按末端派送模式，快遞一般可以送貨到家，物流一般不送貨上門(mén)；按倉儲不同，快遞注重及時(shí)性，隨到隨走，物流倉儲則根據需求而定。
由于兩類(lèi)企業(yè)的業(yè)務(wù)都涉及運輸業(yè)務(wù)（快遞同城除外），人們還是習慣將上述兩類(lèi)企業(yè)統稱(chēng)為物流企業(yè)。營(yíng)改增后，運輸業(yè)務(wù)與收派業(yè)務(wù)適用不同稅率，這就使物流企業(yè)產(chǎn)生了以下5個(gè)方面的涉稅風(fēng)險點(diǎn)，需引起注意。
一是混淆收入類(lèi)別
《營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)實(shí)施辦法》（財稅〔2016〕36號附件1）規定，一般納稅人從事交通服務(wù)應按11%的稅率納稅，從事物流輔助服務(wù)按6%的稅率納稅。同時(shí)，該文件規定：“交通運輸服務(wù)，是指利用運輸工具將貨物或者旅客送達目的地，使其空間位置得到轉移的業(yè)務(wù)活動(dòng)，包括陸路運輸服務(wù)、水路運輸服務(wù)、航空運輸服務(wù)和管道運輸服務(wù)。物流輔助服務(wù)包括航空服務(wù)、港口碼頭服務(wù)、貨運客運場(chǎng)站服務(wù)、打撈救助服務(wù)、裝卸搬運服務(wù)、倉儲服務(wù)和收派服務(wù)”。有的物流企業(yè)，故意混淆收入類(lèi)別，將交通運輸業(yè)務(wù)申報為物流輔助服務(wù)業(yè)務(wù)，少繳納增值稅，造成企業(yè)的稅負明顯偏低，甚至長(cháng)期留抵稅款。
二是發(fā)票開(kāi)具錯誤
《發(fā)票管理辦法》第二十二條規定，開(kāi)具發(fā)票應當按照規定的時(shí)限、順序和欄目，全部聯(lián)次一次性如實(shí)開(kāi)具，并加蓋發(fā)票專(zhuān)用章?！秶叶悇?wù)總局關(guān)于修訂〈增值稅專(zhuān)用發(fā)票使用規定〉的通知》（國稅發(fā)〔2006〕156號）第十一條規定，專(zhuān)用發(fā)票開(kāi)具應項目齊全，與實(shí)際交易相符。但有的物流企業(yè)利用客戶(hù)多是零星貨物運輸，金額不大，不會(huì )較真的心理，或是利用客戶(hù)對稅法不了解，以為零星貨物運輸就是物流輔助服務(wù)，未按規定開(kāi)具發(fā)票，將“運輸服務(wù)”項目開(kāi)具為“物流輔助服務(wù)”項目，造成虛開(kāi)發(fā)票風(fēng)險。
三是收入核算不準確
《營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)有關(guān)事項的規定》（財稅〔2016〕36號附件2）規定，一般納稅人的收派服務(wù)可以選擇適用簡(jiǎn)易計稅方法計稅。因此，物流企業(yè)需要將簡(jiǎn)易計稅項目與一般計稅項目分開(kāi)核算，分別核算適用不同稅率或者征收率的銷(xiāo)售額；未分別核算的，從高適用稅率。但是，有的物流企業(yè)未分別核算不同業(yè)務(wù)營(yíng)業(yè)額，而是將收取的包括快遞費、運費在內全部或大部分，作為收派服務(wù)申報納稅。
四是隱瞞銷(xiāo)售服務(wù)
一般而言，快遞費由收件費、運輸費和送件費等組成，快遞費則是一次性收取，需要快遞總公司與加盟商結算收派費用。由于加盟商納稅人的身份問(wèn)題，一般納稅人采用簡(jiǎn)易計稅辦法計稅，導致部分快遞企業(yè)難以獲得增值稅專(zhuān)用發(fā)票抵扣或者獲得的增值稅專(zhuān)用發(fā)票抵扣不足，于是，一些納稅人干脆采取隱瞞銷(xiāo)售服務(wù)，與加盟商結算時(shí)實(shí)行賬外結算。
五是進(jìn)項稅額核算不完善
物流企業(yè)既有簡(jiǎn)易計稅方法業(yè)務(wù)，又有一般計稅方法業(yè)務(wù)?！稜I(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)實(shí)施辦法》（財稅〔2016〕36號附件1）第二十七條規定，用于簡(jiǎn)易計稅方法計稅項目的進(jìn)項稅額不得從銷(xiāo)項稅額中抵扣。但是，有的物流企業(yè)未將進(jìn)項稅額合理劃分，存在多抵扣進(jìn)項稅額的風(fēng)險。
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